一个员工本月应发工资是2040元,扣除应交的社保金后(单位代扣)是1980,请问该位员工本月要交个人所得税吗?如果交税,要怎样计算税款,分录怎样写?

不用交。

你看下这个贴，关于个税问题，讲解的非常清楚：
http://www.52kuaiji.com/thread-3803-1-1.html